Причин, які призводять до псування молока, а саме до його Прокисання - кілька. Основна причина прокісанія молока при його зберіганні - бактеріальна забрудненість. Це показник кількості мікроорганізмів, що припадають на один кубічний сантиметр об'єму молока. На сьогоднішній день кількість бактерій, які входять до складу молока і призводять до його псування, значно вище, ніж двадцять років тому. Тому бактерицидні властивості молока через такої великої кількості грибків і бактерій значно сокращается.Когда свіже молоко надходить на переробні підприємства, воно проходить через пастеризацію, і через цієї процедури воно втрачає свою природну властивість - здатність захисту від прокісанія. У молоці містяться цвілеві грибки, бактерії і дріжджі, які потрапляють у свіжий продукт із зовнішнього середовища в процесі доїння. Результатом недотримання правил зберігання та гігієни при переробці молока на молокозаводах є збільшення бактеріального обсіменіння. Що в свою чергу погіршує смакові якості молочного продукту, знижує його поживну цінність, а також призводить до значного зниження його термінів храненія.На стадії обробки високою температурною в молоці молочнокислі бактерії гинуть, а інші шкідливі для організму людини маслянокислі бактерії і їх спорові різновиди благополучно виживають . При дотриманні термінів зберіганні молока, навіть при дуже низьких температурах, що залишилися в ньому бактерії і їх спорові різновиди продовжують розвиватися. При цьому такі бактерії і викликають прокісаніе молока.Прокісанію молока може також сприяти і його забруднення різними контоменантами, наприклад, такими як, нітрати, пестициди та антибіотики, а також дезінфікуючі і миючі засоби, що застосовуються в процесі обробки ємностей, де зберігається молочна продукція.