Колір райдужної оболонки залежить від кількості пігменту і кровонаповнення її судин. Пігменти можуть говорити про яке-небудь захворювання, наприклад, жовтий або коричневий пігмент з'являється при хворобах печінки. Колір природних пігментів залежить від генів, національності, раси.


Колір райдужної оболонки визначається змішуванням кольору крові в судинах і змішанням кольору пігментів, наприклад, зелений - це суміш жовтого і синього. Жовтих очей у людей не буває, але якщо кровоносні судини райдужної оболонки блідого кольору, то може вийти жовто-зелений колір. При великій концентрації меланіну райдужна оболонка набуває чорний відтінок, сірий колір - це різновид синього.


Буває, що у людини очі різного кольору. Це явище називається гетерохромія. Різниця в кольорі з'являється внаслідок нестачі (надлишку) меланіну. Такий феномен зустрічається як у людей, так і у тварин (у кішок).


Гетерохромія буває двох видів: повна та часткова. Повна гетерохромія виникає в тих випадках, коли колір райдужної оболонки повністю відрізняється від кольору «райдужки» іншого ока. Часткова гетерохромія зустрічається дуже рідко, приблизно у 4 осіб з 1 мільйона, тоді одна частина «райдужки» відрізняється від залишилася її частини, тобто одне око поєднує в собі два кольори.


Гетерохромія відбувається після запліднення клітини, вона жодним чином не позначається на здоров'ї людини. Люди з цим феноменом бачать все навколишнє і сприймають його, як і всі інші. Найчастіше вона зустрічається у представниць слабкої статі, ніж у чоловіків. Бували випадки, що гетерохромія ставала придбаної через захворювання або травми (синдром Ваарденбурга або хвороба Гіршпрунга).


Люди з гетерохромії набувають якусь родзинку, серед них багато відомих і популярних співаків, актрис: Кейт Босворт (секторная гетехромія), Девід Боуї (псевдогетерохромія через травму), Крістофер Уокен і т.д.