Починаючи з 2009-го року, ЄДІ став заміняти собою випускні та вступні іспити. Причин для встановлення такої форми перевірки було кілька. По-перше, переслідувалася мета забезпечити однакові умовах для складання іспитів всім школярам. Тому всі завдання в ЄДІ однотипні, як і шкала підсумкової оцінки. Це дає можливість порівняти всіх учнів за рівнем підготовки.

За допомогою такої системи перевірки також хотіли викорінити хабарництво при вступі до ВНЗ та цільове репетиторство, єдине завдання якого - прийом в певний навчальний заклад. Вважається, що умови проведення ЄДІ повністю сприяють отриманню виключно достовірних результатів. Справа в тому, що завдання частини А (всього іспит розділений на три частини) перевіряються комп'ютером, а відповіді з частин В і С - незалежними експертами.

Наступною метою була спроба поліпшити, підняти на більш високий рівень якість освіти в РФ. Це хотіли здійснити завдяки суворому контролю на іспиті. Для довідки: при проведенні ЄДІ в кабінеті мають право перебувати тільки два викладачі, які повинні бути незнайомі з учнями, що здають іспит. Тобто «свій» керівник спостерігати за проведенням ЄДІ ніяк не зможе, а тим більше, якось допомогти здають. Це заборонено відповідним законом, порушення якого суворо карається.

Інша поставлена задача полягала в знятті великих навантажень з абітурієнтів. Тепер можна скласти єдиний іспит, результати якого будуть враховуватися як у шкільному атестаті, так і під час вступу до ВНЗ.

Учень може сам вибирати ті предмети, за якими він буде здавати ЄДІ. Однак він не має права відмовитися від здачі математики та російської мови, оскільки ці предмети є обов'язковими для отримання атестата.