Поширеною причиною болю в небі є механічне пошкодження (подряпини, порізи) при жуванні. Тверда їжа, кістки легко ранять слизову оболонку неба. Ранка може запалитися і викликати дискомфорт, хоча сильним болем це не назвеш.

Тверде небо, що кріпиться до окістя за верхніми зубами, може хворіти внаслідок карієсу, пульпіту, остеомієліту (запалення кістки) верхньої щелепи, пародонтиту (запалення тканин, що оточують зуб). При цьому пульсуючий біль в місці запалення поширюється і на небо. Як і тканини, що оточують зуб безпосередньо, небо реагує ниючий болем на холодне, гаряче, з'являється біль при жуванні.

Не останнє місце в ряду причин займає і запалення мигдалин, відростків м'якого піднебіння, або ангіна. Мигдалини складаються з лімфоїдної тканини, названі так через свою овальної форми. Вони покриті епітелієм (покривної тканиною) горбистої неправильної форми з безліччю поглиблень. Деякі хвороботворні мікроби, «застряє» в поглибленнях (кавернах), викликають запалення мигдалин, почервоніння тканин навколо, підвищення температури, біль в області горла та м'якого піднебіння.

В області неба проходять трійчастий, симпатичні, черепні нерви. Невралгія (запалення) всіх цих нервів може бути причиною хворобливих відчуттів в небі. Хворобливі відчуття відбуваються також від дисфункції скронево-щелепного суглоба, при цьому можуть хворіти і щелепи, і небо, і скроню.

Захворювання слизових оболонок ротової порожнини також безпосередньо позначаються на небі. Стоматит - ураження слизової оболонки порожнини рота. Він викликається різними причинами, однією з яких називають вірусну інфекцію, герпес, на тлі ослаблення імунної системи. Реакція слизової виражається в появі виразок з характерним білястим нальотом і гіперемією по краю. Біль у покривах ротової порожнини - один з головних симптомів захворювання.

Загалом можна сказати, що болі в небі обумовлені близькістю лицьових нервів, ураженням слизової оболонки ротової порожнини, захворюваннями зубів і мигдалин.